Сложные геолого-гидрогеологические условия и неравномерные как в пространстве, так и во времени техногенные нагрузки обусловливают необходимость изучения гидрогеодинамического режима. На территориальном уровне ведения мониторинга основной метод изучения режима – замеры уровня, температуры и изучение химического состава подземных вод в скважинах.
Наблюдения ведутся по сети, состоящей из 11 скважин государственной опорной наблюдательной сети (ГОНС), и 50 скважин объектной наблюдательной сети. В перечень наблюдаемых включены скважины, пригодные по техническому состоянию и отвечающие поставленным задачам. Выбор скважин объектной сети также основывался на принципе полноты получения гидродинамической и гидрохимической информации для ее дальнейшего комплексного анализа и дальнейшего принятия органами власти управленческих решений